Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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