Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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