Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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ptchd1Q14B62 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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ptchd1Q14B62 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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ptchd1Q14B62 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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ptchd1Q14B62 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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ptchd1Q14B62 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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ptchd1Q14B62 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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