Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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Hoxd1Q01822 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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Hoxd1Q01822 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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