Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Rps29P62274 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Rps29P62274 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Rps29P62274 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Rps29P62274 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
Rps29P62274 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Rps29P62274 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.6 ms