Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RabggtbP53612 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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