Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rpl28P41105 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rpl28P41105 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms