Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PtprmP28828 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PtprmP28828 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PtprmP28828 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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