Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RxraP28700 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RxraP28700 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RxraP28700 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RxraP28700 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RxraP28700 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RxraP28700 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RxraP28700 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RxraP28700 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RxraP28700 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms