Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
P10404 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
P10404 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
P10404 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
P10404 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P10404 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms