Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FxnO35943 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FxnO35943 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FxnO35943 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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FxnO35943 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FxnO35943 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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FxnO35943 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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FxnO35943 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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FxnO35943 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FxnO35943 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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FxnO35943 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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FxnO35943 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FxnO35943 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FxnO35943 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FxnO35943 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FxnO35943 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FxnO35943 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FxnO35943 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FxnO35943 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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