Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Nedd9O35177 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Nedd9O35177 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Nedd9O35177 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Nedd9O35177 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Nedd9O35177 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Nedd9O35177 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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