Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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