Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cdh18E9Q9Q6 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Cdh18E9Q9Q6 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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