Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Gm3893E9Q1I1 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Gm3893E9Q1I1 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Gm3893E9Q1I1 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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Gm3893E9Q1I1 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms