Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms