Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Grik3B1AS29 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.4 ms