Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Col4a3Q9QZS0 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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