Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
Cln8Q9QUK3 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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