Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1Q9JM13 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Rabgef1Q9JM13 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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