Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Usp29Q9ES63 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp29Q9ES63 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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