Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc47Q9D024 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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