Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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Sgo1Q9CXH7 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sgo1Q9CXH7 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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Sgo1Q9CXH7 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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Sgo1Q9CXH7 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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Sgo1Q9CXH7 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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Sgo1Q9CXH7 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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Sgo1Q9CXH7 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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Sgo1Q9CXH7 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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