Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Usp38Q8BW70 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Usp38Q8BW70 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Usp38Q8BW70 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Usp38Q8BW70 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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Usp38Q8BW70 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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Usp38Q8BW70 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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