Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Actn1Q7TPR4 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Actn1Q7TPR4 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Actn1Q7TPR4 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Actn1Q7TPR4 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Actn1Q7TPR4 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Actn1Q7TPR4 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Actn1Q7TPR4 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Actn1Q7TPR4 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Actn1Q7TPR4 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Actn1Q7TPR4 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.7 ms