Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NipblQ6KCD5 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
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