| Hoxa13 | Q62424 | Snord50b-201 | ENSMUST00000178497 | 72 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm27698-201 | ENSMUST00000184060 | 249 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm33866-201 | ENSMUST00000196911 | 289 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm43676-201 | ENSMUST00000197532 | 540 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm18991-201 | ENSMUST00000209225 | 746 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | AC158597.1-201 | ENSMUST00000216234 | 150 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm11351-202 | ENSMUST00000225724 | 478 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Snord7-201 | ENSMUST00000083781 | 97 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Vmn1r28-202 | ENSMUST00000227805 | 10892 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr136-204 | ENSMUST00000214035 | 1925 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm11414-201 | ENSMUST00000121795 | 263 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm2869-201 | ENSMUST00000124359 | 2621 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr1448-202 | ENSMUST00000213177 | 3979 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Mgat4c-201 | ENSMUST00000020039 | 3735 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Mir92-1-201 | ENSMUST00000102108 | 80 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22270-201 | ENSMUST00000104034 | 132 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm15497-201 | ENSMUST00000119137 | 551 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Vmn2r-ps58-201 | ENSMUST00000173044 | 242 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm28344-201 | ENSMUST00000185704 | 279 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm38311-201 | ENSMUST00000192945 | 165 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm44182-201 | ENSMUST00000204052 | 115 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Olfr420-202 | ENSMUST00000213748 | 3806 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr509-203 | ENSMUST00000214861 | 3535 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm45257-201 | ENSMUST00000210301 | 3998 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm22800-201 | ENSMUST00000175627 | 94 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Snhg14-209 | ENSMUST00000188976 | 2193 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm45116-201 | ENSMUST00000207392 | 275 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr606-202 | ENSMUST00000214631 | 2649 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm4945-201 | ENSMUST00000075152 | 453 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm10234-201 | ENSMUST00000089304 | 60 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Vmn2r72-201 | ENSMUST00000063425 | 2571 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm42862-201 | ENSMUST00000197494 | 2621 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Pak3-205 | ENSMUST00000112868 | 8163 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm24274-201 | ENSMUST00000116787 | 124 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm11285-201 | ENSMUST00000118443 | 322 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm10722-201 | ENSMUST00000151376 | 651 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25059-201 | ENSMUST00000157367 | 117 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm24075-201 | ENSMUST00000158175 | 72 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm16404-201 | ENSMUST00000177739 | 468 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm14598-201 | ENSMUST00000180109 | 468 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm14625-201 | ENSMUST00000180231 | 468 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm28900-201 | ENSMUST00000185232 | 156 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm29553-201 | ENSMUST00000189692 | 279 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm18346-201 | ENSMUST00000216782 | 325 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22248-201 | ENSMUST00000082482 | 150 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm26265-201 | ENSMUST00000083277 | 135 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm10192-201 | ENSMUST00000086672 | 327 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm42770-201 | ENSMUST00000199657 | 4155 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr103-202 | ENSMUST00000173472 | 3079 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm43889-201 | ENSMUST00000203950 | 3681 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr109-203 | ENSMUST00000214938 | 5550 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm24263-201 | ENSMUST00000104059 | 107 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm14491-201 | ENSMUST00000121919 | 199 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22281-201 | ENSMUST00000157198 | 103 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm16004-201 | ENSMUST00000161981 | 311 nt | TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |