Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms