Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ttf2Q5NC05 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ttf2Q5NC05 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms