Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp39Q3TIX9 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp39Q3TIX9 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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