Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Trim71Q1PSW8 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trim71Q1PSW8 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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