Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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ptchd1Q14B62 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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ptchd1Q14B62 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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ptchd1Q14B62 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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ptchd1Q14B62 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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ptchd1Q14B62 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ptchd1Q14B62 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ptchd1Q14B62 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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