Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ttc39dQ0VF76 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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Ttc39dQ0VF76 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ttc39dQ0VF76 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms