Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ttc21bQ0HA38 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ttc21bQ0HA38 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms