Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd1Q01822 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd1Q01822 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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