Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RabggtbP53612 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RabggtbP53612 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RabggtbP53612 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RabggtbP53612 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RabggtbP53612 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RabggtbP53612 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RabggtbP53612 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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