Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VdrP48281 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VdrP48281 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VdrP48281 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VdrP48281 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
VdrP48281 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
VdrP48281 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
VdrP48281 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
VdrP48281 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VdrP48281 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VdrP48281 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VdrP48281 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms