Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PtprmP28828 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PtprmP28828 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms