Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RxraP28700 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RxraP28700 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RxraP28700 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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