Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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Zfp558E9Q1J0 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Zfp558E9Q1J0 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
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Zfp558E9Q1J0 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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Zfp558E9Q1J0 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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Zfp558E9Q1J0 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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Zfp558E9Q1J0 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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Zfp558E9Q1J0 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Zfp558E9Q1J0 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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