Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc6D3YZP9 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc6D3YZP9 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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