Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trabd2bB1ATG9 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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Trabd2bB1ATG9 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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Trabd2bB1ATG9 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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Trabd2bB1ATG9 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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Trabd2bB1ATG9 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
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Trabd2bB1ATG9 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trabd2bB1ATG9 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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