Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CtcflA2APF3 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CtcflA2APF3 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
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