Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms