Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r17Q9Z2E4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r17Q9Z2E4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms