Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd1Q9Z2E2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms