Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tulp1Q9Z273 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms