Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn8Q9Z260 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms