Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ube2aQ9Z255 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube2aQ9Z255 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms