Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lgr5Q9Z1P4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms